筛选和发现目的基因调控元件的特异性结合蛋白是进行基因转录水平调控研究的核心内容。
将 DNA pull-down 技术和质谱(MS) 结合 (DNA-PD-MS),可高通量筛选基因的特定调控原件与转录因子的互作网络,有助于理解在转录水平上基因表达调控的过程。
SILAC-DNA-PD-MS 是将SILAC (Stable Isotope Labeling with Amino acids in Cell culture) 细胞标记和DNA-PD-MS 结合,可通过质谱定量快速锁定基因调控原件(DNA) 的特异性结合蛋白,后续DNA-PD-WB 验证成功率高。
与 SILAC-DNA-PD-MS 技术相比,DNA-PD-MS 只能定性,无法从背景蛋白中区分特异性相互作用,挑选要验证的DNA 结合蛋白费时费力,验证成功率低。
*谱璟科技 DNA-PD-MS技术平台*
谱璟科技 DNA-PD-MS技术流程:
DNA-PD-MS应用场景及特点:
*谱璟科技 SILAC-DNA-PD-MS技术平台*
谱璟科技 SILAC-DNA-PD-MS技术流程:
SILAC-DNA-PD-MS应用场景及特点:
参考文献:
Sci Transl Med. 2019; 11(510): eaaw2050.
Journal of Molecular Biology.2019;431(19):3606-25.
PNAS. 2013;110(17):6771-6.