“泛”蛋白翻译后修饰 (PTMs) —质谱分析

PTMs

  • 蛋白质组(Proteome)所包括的蛋白质种类、复杂度、动态性远超基因组和转录组。细胞、组织、物种的蛋白质组应包括(1)表达的所有蛋白质的种类;(2) 蛋白质的各种isoform;(3)各种翻译后修饰(PTM variant)。在细胞/组织种,总体的Proteoforms(单个基因生成的所有蛋白质形式,包括全长、isoform和各种PTMs)估计超过100万种。

  • 蛋白质是细胞的功能分子,是指针机体生理/病理变化的动态指标。PTMs是动态调控的核心。

  • 对于PTMs的研究主要有两种类型;(1)基因抗体,(2)基于质谱,进行高通量的筛选及聚焦深挖。

  • 在蛋白质PTMs研究领域,谱璟科技可提供:

  1. 高通量筛选:多种基于抗体或者(甲基化、乙酰化、磷酸化等)的PTMs高通量筛选服务;

  2. 个性化分析:聚焦靶蛋白(研究已有要聚焦研究的目的蛋白)的深度、个性化的PTM筛选与发现。基于我们IP-MS和SILAC-IP-MS技术平台,高质量的富集靶蛋白后,利用多样化的质谱方案进行个性化的PTMs鉴定和发现。

PTMs-2

谱璟科技基于我司的IP-MS技术平台,对靶点蛋白(target)进行了高质量的富集后,利用质谱对富集的靶蛋白(target)进行了质谱检测和数据分析。从质谱谱图可见,在K上发现了一个全新的乙酰化位点(acetylation,ac,y2=345.2328,左图)。右图是对照样品(y2=303.2104)。两个y2粒子质量之差为42 Da,与乙酰化的质量修饰符合。其余粒子对—y4,y5,y7,y8,y9,y10同理,均相差42 Da。



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